![]() ![]() Фузионный пептид E5 в бислое из димиристоилфосфатидилхолина (DMPC). Глубокое встраивание пептида внутрь интерфейса мембраны в ходе МД-расчета приводит к вытеснению нескольких липидных молекул в водную фазу. Этот эффект вызван сильным электростатическим взаимодействием глутаматных остатков пептида (в частности, E11, E15, E19) с холиновыми группами липидов. Интерфейс вода–липиды схематически представлен серой плоскостью. Молекулы воды не показаны. (Volynsky et al., Biochemistry, 2005). Среди основных направлений наших исследований — компьютерное моделирование мембранных и мембрано-активных пептидов и белков. Отдельное внимание уделяется разработке моделей сольватации белков в мембрано-имитирующем окружении. Мы работаем со следующими объектами: кардиотоксины, антимикробные и фузионные пептиды, семиспиральные трансмембранные рецепторы из семейства GPCR, трансмембранные димеры белков (гликофорин A, рецепторы тирозинкиназ и др.), сигнальные пептиды. Основные цели: понимание взаимосвязи «пространственная структура–функция» для мембран и мембранных белков при помощи техники молекулярного моделирования. Направления исследований:
Используемые методы:
Ознакомьтесь с нашими вычислительными ресурсами и программным обеспечением. Узнайте, как связаться с нами. |
Адрес: 117997 Россия, Москва, ул. Миклухо-Маклая, д. 16/10. | © 2003–2007 |