Среди основных направлений наших исследований — компьютерное моделирование мембранных и мембрано-активных пептидов и белков. Отдельное внимание уделяется разработке моделей сольватации белков в мембрано-имитирующем окружении. Мы работаем со следующими объектами: кардиотоксины, антимикробные и фузионные пептиды, семиспиральные трансмембранные рецепторы из семейства GPCR, трансмембранные димеры белков (гликофорин A, рецепторы тирозинкиназ и др.), сигнальные пептиды.

Основные цели: понимание взаимосвязи «пространственная структура–функция» для мембран и мембранных белков при помощи техники молекулярного моделирования.

Направления исследований:

• Разработка in silico технологий для направленного создания новых лекарств, действующих на биомембраны и мембранные белки;
• Мембранные пептиды и белки: структура, связывание с мембраной, моделирование функции;
• Гидрофобная/гидрофильная организация глобулярных и мембранных белков;
• Моделирование белков на основании гомологии;
• Компьютерная биоинженерия белков: конструирование функционально важных мутантных и химерных белков, de novo молекулярный дизайн новых биологически активных соединений с заданными свойствами.
• Список проектов →

Используемые методы:

• Методы Монте-Карло и молекулярной динамики в неявно и явно заданных средах (включая биомембраны);
• Предсказание трехмерной структуры белка, основанное на анализе аминокислотной последовательности и технике «протягивания»;
• Молекулярный докинг и предсказание активности;
• Квантово-химические расчеты;
• Расчеты молекулярного гидрофобного потенциала;
• Анализ электростатических взаимодействий в белках, оценка термостабильности.

Ознакомьтесь с нашими вычислительными ресурсами и программным обеспечением.

Узнайте, как связаться с нами.

© 2003–2007
batch2k.